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厌氧菌研究组


组长：东秀珠 博士 研究员

 微生物资源前期开发国家重点实验室主任

电话：010-64807413
E-mail: dongxz@im.ac.cn

 

 

 

研究目标：

      厌氧菌研究组研究厌氧菌资源、生物学和种间相互作用，目标是了解在重要厌氧降解生境中参与物质代谢的厌氧菌的生物学特征，为利用它们的代谢能力奠定基础。

 

研究内容：

      复杂有机物厌氧降解产生甲烷的过程由3种代谢类型的厌氧微生物--发酵细菌、互营产乙酸细菌和甲烷古菌协同代谢完成。瘤胃中发生的纤维素秸秆降解转化为有机酸（动物营养物质）和甲烷是一个典型有机物厌氧降解过程，因为其中生活多种降解复杂纤维素和产甲烷的厌氧微生物。甲烷古菌是唯一以大量甲烷为代谢产物的生物，是全球甲烷排放的主要功能菌。研究这些厌氧微生物的资源、生物学特征和它们之间的种间相互作用机理，对认识有机物的生物转化过程的本质具有重要的理论意义。

      链球菌是兼性厌氧细菌。口腔中生活着各种链球菌，其中变型链球菌因产生大量乳酸，并能够粘附到牙齿表面而被认为是主要的致龋细菌；而一些口腔链球菌则能够产生某些抑菌物质而拮抗变型链球菌的生长。研究它们的种间作用有助于认识自然环境中微生物物种之间，以及微生物与环境相互作用的机制。

      本实验室致力于瘤胃纤维素厌氧细菌、甲烷古菌的资源和分子系统学，以及口腔链球菌种间相互作用的研究。目前的研究重点是：

（1）牦牛瘤胃纤维素降解细菌的生物学和纤维素降解的酶学，及其瘤胃元基因组学研究，重点是纤维素降解基因的筛选和表达；

（2）青藏高原湿地甲烷释放的途径和功能低温甲烷古菌的资源，及其冷适应的代谢研究；

（3）口腔链球菌抑制变型链球菌的分子机理，及其双组分系统调控的链球菌的生物膜形成。

实验室成员：

课题组长

          东秀珠，博士、研究员、博士生导师。

1994年毕业于荷兰Wageningen大学，获博士学位。
1995年至1996年在美国阿拉巴马州立大学作博士后。
2000年获得国家杰出青年基金。
2004年入选中国科学院“百人计划”，作为首席科学家主持国家科技部973项目。
现任中国科学院微生物研究所微生物资源研究中心副主任，微生物资源前期开发国家重点实验室主任，中国微生物学会常务理事，国际交流工作委员会主任，《微生物学报》副主编，《微生物学通报》和《生物多样性》编委。

目前主要研究厌氧细菌和古菌的资源、分子系统学和种间相互作用。

电话：010-64807413
E-mail: dongxz@im.ac.cn

副研究员

佟卉春　
Ms. Huichun Tong
Associate Professor
Tonghuichun@sun.im.ac.cn

高级实验师

刘晓黎 　
Ms. Xiaoli Liu
Senior Technician
liuxl@sun.im.ac.cn

研究生 (Graduate Students)

张科贵 Kegui Zhang, 2003-2008
牛莉莉 Lili Niu, 2004-2007
陈   伟 Wei Chen, 2004-2007
宋   磊 Lei Song, 2005-2008
蔡世淳 Shichun Cai, 2004-2009
张桂山 Guishan Zhang, 2006-2009
祝金星 Jinxing Zhu, 2005-2010
朱宝利 Baoli Zhu，2006-2011
李家宝 Jiabao Li， 2007-2010


客座研究生(Visiting graduate students)

田建卿 Jianqing Tian
蒋   娜 Na Jiang
张   杰 Jie Zhang

代表性图片

          FISH杂交显微图像显示的所有甲烷菌                      ZC-I甲烷菌特异性探针的杂交图像

 

                                   变型链球菌                     寡发酵链球菌
                             在PYG培养基上寡发酵链球菌抑制变型链球菌生长

 

                                  生物膜状态下寡发酵链球菌抑制变型链球菌
                                红细胞：变型链球菌；绿细胞：寡发酵链球菌

 

最近发表论文

  1. Jianqing Tian, Yanfen Wang, Xiuzhu Dong*.  2010. Methanoculleus hydrogenotrophus sp. nov., a novel methanogenic archaeon isolated from Tibetan Plateau in China . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology    (Online published as doi:10.1099/ijs.0.019273-0) (IF 2.222)
  2. Shichun Cai and Xiuzhu Dong*. 2010. Cellulosilyticum ruminicola gen. nov., sp. nov., isolated from yak rumen contents, and reclassification of Clostridium lentocellum as Cellulosilyticum lentocellum comb. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology    (Online published as doi:10.1099/ijs.0.014712-0) (IF 2.222)
  3. Kegui Zhang, Lei Song, and Xiuzhu Dong*. 2010. Proteiniclasticum ruminis gen. nov., sp. nov., a strictly anaerobic proteolytic bacterium isolated from yak rumen, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology    (Online published as doi:10.1099/ijs.0.011759-0) (IF 2.222)
  4. Na Jiang, Yanfen Wang, Xiuzhu Dong*. 2010. Methanol as the Primary Methanogenic and Acetogenic Precursor in the Cold Zoige Wetland at Tibetan Plateau. Microbial Ecology. (Online published as doi: 10.1007/s00248-009-9602-0) PDF (IF 2.885)
  5. Kegui Zhang, Xiuzhu Dong*. 2009. Selenomonas bovis sp. nov., isolated from yak rumen contents. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59: 2080-2084 (IF 2.222)
  6. Lei Song and Xiuzhu Dong*, 2009, Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans gen. nov., sp. nov., isolated from the H2-producing UASB granules. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59: 295-299. (IF 2.222)
  7. Lei Song and Xiuzhu Dong*. (2009). Clostridium amylolyticum sp. nov., isolated from H2-producing UASB granules. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58: 2132-2135 (IF 2.222)
  8. Guishan Zhang#, Jianqing Tian#, Na Jiang, Xiaopeng Guo, Yanfen Wang and Xiuzhu Dong*, 2008, Methanogen community in Zoige wetland of Tibetan plateau and phenotypic characterization of a dominant uncultured methanogen cluster ZC-I, Environmental Microbiology 10(7): 1850–1860 PDF (#shared the first author)(IF 4.929)
  9. Huichun Tong, Wei Chen, Wenyuan Shi, Fengxia Qi, and Xiuzhu Dong*. 2008. SO-LAAO, a Novel L-Amino Acid Oxidase That Enables Streptococcus oligofermentans To Outcompete Streptococcus mutans by Generating H2O2 from Peptone. Journal of Bacteriology. 190:4716-4721 PDF (IF 4.013)
  10. Guishan Zhang, Na jiang, Xiaoli Liu, Xiuzhu Dong*. 2008. Methanogenesis from Methanol at Low Temperature by a Novel Psychrophilic Methanogen, Methanolobus psychrophilus sp. nov., prevalent in Zoige Wetland of Tibetan Plateau. Applied and Environmental Microbiology 74,19:6114-6120 PDF (IF 4.004)
  11. Lei Sun, Fubin Qiu, Xiaoxia Zhang, Xin Dai, Xiuzhu Dong*, Wei Song*, 2008,  Endophytic Bacterial Diversity in Rice (Oryza sativa L.) Roots Estimated by 16S rDNA Sequence Analysis, Microbial Ecology, 55(3) 415-424 PDF (IF 2.558)
  12. Lili Niu, Lei Song and Xiuzhu Dong*, 2008, Proteiniborus ethanoligenes gen. nov., sp. nov., an anaerobic protein-utilizing bacterium, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology PDF (IF 2.384)
  13. Lei Song and Xiuzhu Dong*. 2008, Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans gen. nov., sp. nov., isolated from the H2-producing UASB granules. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, (Accepted) (IF 2.384)
  14. Lei Song and Xiuzhu Dong*. 2008. Clostridium amylolyticum sp. nov., isolated from H2-producing UASB granules. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, (in print) PDF (IF 2.384)
  15. Huichun Tong, Wei Chen, Justin Merritt, Fengxia Qi, Wenyuan Shi, Xiuzhu Dong*. Streptococcus oligofermentans inhibits Streptococcus mutans through conversion of lactic acid into inhibitory H2O2: a possible counteroffensive strategy for inter-species competition. Molecular Microbiology 63（3）:872-880，2007.
  16. Chenggang Wu, Xiaoli Liu and Xiuzhu Dong Syntrophomonas wolfei subsp. methylbutyratica subsp. nov., and assignment of Syntrophomonas wolfei subsp. saponavida to Syntrophomonas saponavida sp. nov. comb. nov. Sys. Appl. Microbiol. 2007 (in press).
  17. Tong, Hui; Zhu, Baoli; Chen, Wei; Qi, Fengxia; Shi, wenyuan; Dong, Xiuzhu Establishing a Genetic System for Ecological Studies of Streptococcus oligofermentans. FEMS Microbiology Letters 264： 213–219, 2006.
  18. Chenggang Wu，Xiaoli Liu and Xiuzhu Dong Syntrophomonas cellicola sp. nov., a novel sporeforming syntrophic bacterium isolated from a distilled-spirit-fermenting cellar and assignment of Syntrophospora bryantii to Syntrophomonas bryantii sp. nov., comb. nov. Inter. J. System. Evolution. Microbiol. 56（10）2331-2335.2006.
  19. Kai Ma, Xiaoli Liu, Xiuzhu Dong Methanosaeta harundinacea, sp. nov., a novel acetate-scavenging methanogen isolated from a UASB reactor. Inter. J. System. Evolution. Microbiol.56:127-131 2006.