我所是国务院批准的首批具有博士、硕士授予权的科研单位，自1978年恢复研究生招生制度至今，共培养研究生近千名。最近几年来，硕士及博士招生中多项指标均名列全院前十名以内。逐步确立了从招生、培养、学位授予、就业等“全生命周期”管理的理念。研究生教育在研究所工作中的权重逐年增加，受到历任所领导的重视。目前我所设有微生物学、遗传学、生物化学与分子生物学三个二级学科，并设有博士后流动站；新增生物工程专业学位硕士培养点。
12月8日，广西大学校长、党委副书记肖建庄一行四人来访微生物研究所。双方围绕学科共建、科研协同、人才联合培养等议题展开座谈。
日前，2022年度中国科学院院长奖、中国科学院优秀博士学位论文、中国科学院优秀导师奖、中国科学院地奥奖学金、中国科学院大学朱李月华优秀博士生奖学金先后揭晓。中国科学院微生物研究所研究生及导师获得多项荣誉。
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