微生物所高程团队揭示细菌组与抗性组对城市化的差异响应机制

自从20世纪中叶以来，地球全面进入“人类世”。高度城市化、全面工业化和农业集约化深刻重塑地球微生物组，并对环境与人类健康产生反馈效应。中国科学院微生物研究所高程团队围绕典型人类世生境，系统解析了土壤细菌群落与抗生素抗性组的周转模式及共现规律。

研究发现，城市化对细菌组和抗性组的影响呈相反趋势：在不同城市间，细菌群落趋于同质化、β多样性降低；而抗生素抗性基因组成则呈现出城市间异质化、β多样性升高，表明了不同城市中形成了特异性的抗性谱。同时，城市化还进一步重塑了菌群和抗性组的网络特征：细菌共发生网络遭到破坏，复杂度和稳定性下降；相反，抗性基因之间的共发生网络却更加复杂且稳健，提示城市化促进了多类抗性基因的局地富集、协同出现和跨地域传播。该研究揭示了人类世细菌组与抗性组的差异响应机制，为理解环境耐药性的发生、维持与传播提供了科学支撑。

相关研究成果以“Soil resistome and bacteriome differ in continental-scale turnover and co-occurrence across major anthropogenic land-use types”为题，发表于Communications Earth & Environment上。中国科学院微生物研究所博士研究生杨艳为论文第一作者，微生物研究所高程研究员、王聪副研究员为论文共同通讯作者。该研究得到中国科学院战略性先导科技专项等项目支持。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s43247-026-03751-1

人类世促进抗生素抗性基因富集、协同出现和跨地域传播